ABCDは元ソースから変更してないみたいで、TRIMUIはMiyooとはAとYのアサインが逆なので、単純に逆になってしまっているようです。
Liartesさんに報告したら、次回合わせるとのお返事でした。
メニュー操作は、ソース上でBCが決定でAがキャンセルに固定されているように見えます。
うちのMiyoo版ではそうなっていました(下記リンクのもの)。Miyooでもいろいろバージョンがあるのかもしれません。
https://github.com/steward-fu/miyoo/releases/tag/v1.1
なのでおそらくgngeo自体が、NeoGeoCD配列を前提として作られているように思います。
miniは海外ではあんまりメジャーじゃないような気もしますし。
しかしminiはここまで全然違うアサインにしちゃって、混乱することはなかったのでしょうか^_^;