PCSX4allの設定は初期化されていると思うので、設定は初期状態のままでCDイメージを作り直して読み込ませてみるだけでいいと思います。
黄蛇さんの書き込みにもあるように、現在使っているCDイメージを、一度PCのPSエミュレーターを使って壊れてないか確かめるのも手ですが、PC版のエミュレーターをセッティングするぐらいなら、そのままCDイメージを再製作しちゃうのも手っ取り早いかもしれません。
（最初は何のイメージ製作ソフトを使ったか分かりませんが、ある程度実績がある「CD Manipulator」がおすすめです。
使い方はちょっと調べれば分かるぐらい有名です。
調べた限り、ISOファイル１個だけを作る方法と、cueファイルを含む複数ファイルで構成されるイメージを作る方法があるようです。
まぁ複数ファイルを作る方は、結局使うのは img と cue のファイル２個だけのようですが）
何が正解か分かりにくい状況ですので、手につくところから始めるのが良いかと思います。